Osoba na stanowisku typu post-doc w projekcie SONATA BIS pt. „Alfa-mannozydazy szlaku N-glikozylacji białek w komórkach nabłonkowych przewodu pokarmowego. Badania nad ich rolą w modulowaniu glikomu oraz przepuszczalności bariery jelitowej w warunkach fizjologicznych i pod presją stanu zapalnego” (Nr rejestracyjny: 2022/46/E/NZ1/00293, nr SAP K/NCN/000171)

DLA KOGO?

Osoba aplikująca na to stanowisko powinna spełniać poniższe wymagania:

• Posiadać stopień naukowy doktora biologii, biotechnologii, analityki medycznej lub dziedzin pokrewnych uzyskany nie wcześniej niż 7 lat przed rokiem planowanego rozpoczęcia pracy w projekcie (Do okresu tego nie wlicza się przerw związanych z urlopem macierzyńskim, dodatkowym urlopem macierzyńskim, urlopem na warunkach urlopu macierzyńskiego, dodatkowym urlopem na warunkach urlopu macierzyńskiego, urlopem ojcowskim, urlopem rodzicielskim lub urlopem wychowawczym, udzielonych na zasadach określonych w przepisach Kodeksu pracy albo pobierania zasiłku chorobowego lub świadczenia rehabilitacyjnego w związku z niezdolnością do pracy, w tym spowodowaną chorobą wymagającą rehabilitacji leczniczej. W przypadku kobiet, wskazany 7-letni okres można przedłużyć o 18 miesięcy za każde urodzone bądź przysposobione dziecko. Kobieta może wybrać bardziej korzystny sposób wskazania przerw w karierze naukowej);
• Spełniać dodatkowe warunki wynagradzania w konkursach NCN (https://www.ncn.gov.pl/sites/default/files/pliki/uchwaly-rady/2023/uchwala65_2023-zal1.pdf), w tym:  

– kierownik projektu (dr Paweł Link-Lenczowski) nie był promotorem ani promotorem pomocniczym rozprawy Doktorskiej kandydatki/kandydata,

– kandydatka/kandydat uzyskał stopień doktora w podmiocie innym niż podmiot, w którym planowane jest zatrudnienie, lub odbyła co najmniej 10-miesięczny, ciągły i udokumentowany staż podoktorski w podmiocie innym niż podmiot realizujący projekt oraz w kraju innym niż kraj uzyskania stopnia doktora;

• posiadać doświadczenie w pracy badawczej udokumentowane publikacjami naukowymi oraz udziałem w zjazdach i konferencjach naukowych;
• posiadać wiedzę i doświadczenie z zakresu biologii molekularnej i komórkowej;
• posiadać doświadczenie w pracach laboratoryjnych, w tym w zakresie podstawowych technik biochemicznych (np. SDS-PAGE i Western blot, oczyszczanie białek, PCR itp.).
• posiadać doświadczenie z zakresu metod edycji genomu, między innymi w technologii CRISPR-Cas9;
• doświadczenie w zakresie technik HPLC i/lub spektrometrii mas – będzie dodatkowym atutem, ale nie jest obowiązkowe;
• posiadać doświadczenie z zakresu glikobiologii – będzie dodatkowym atutem, ale nie jest obowiązkowe;
• posiadać umiejętność myślenia analitycznego i pracy w zespole;
• wykazywać motywację do rozwoju naukowego i podejmowania nowych wyzwań badawczych;
• posiadać dobrą znajomość języka angielskiego;

INSTYTUCJA FINANSUJĄCA

Narodowe Centrum Nauki

CEL ZATRUDNIENIA

Osoba zatrudniona na stanowisku badawczym typu typu post-doc będzie wykonawcą w projekcie SONATA Bis, którego głównym celem jest poznanie roli alfa-mannozydaz klasy I szlaku N-glikozylacji w modulacji glikomu podczas różnicowania enterocytów oraz roli tych enzymów w biologii bariery nabłonkowej jelit. Jednym z wątków badawczych w projekcie jest opracowanie modeli nabłonkowej bariery jelitowej w warunkach in vitro, z wykorzystaniem komórek z wyciszoną ekspresją wybranych genów kodujących alfa-mannozydaz klasy I. W trakcie realizacji projektu poza standardowymi metodami biochemicznymi (PCR, Western Blot, testy enzymatyczne itp.) czy obrazowymi (mikroskopia fluorescencyjna) stosowane będą najnowocześniejsze techniki analityczne służące do analizy glikomu komórkowego, takie jak spektrometria mas UPLC-IMS-qToF-MS oraz MALDI-ToF-MS.

Opis zadań:

• edycja genomu w komórkach linii CaCo-2 w celu wyciszenia ekspresji genów kodujących wybrane alfa-mannozydazy klasy I, selekcja komórek, weryfikacja skuteczności edycji genomu (qPCR, Western Blot);
• analiza wpływu wyciszenia ekspresji genów kodujących wybrane alfa-mannozydazy klasy I na różnicowanie komórek CaCo-2 w kierunku komórek o fenotypie enterocytów (qPCR i Western blot dla wybranych biomarkerów różnicowania, mikroskopia immunofluorescencyjna, testy enzymatyczne);
• analiza glikomiczna wybranych klonów z nokautem/knockdownem alfa-mannozydaz – qPCR genów związanych z glikozylacją, spektrometria mas N-glikanów komórkowych;
• udział w tworzeniu modeli nabłonkowej bariery jelitowej in vitro (modele 2D i modele mikroprzepływowe „organ on chip”);
• interpretacja danych naukowych, analizy statystyczne danych, udział w pisaniu artykułów naukowych, prezentacja wyników badań na konferencjach.

Nazwa jednostki prowadzącej badania: Zakład Fizjologii Medycznej, Katedra Nauk Biomedycznych, Instytut Fizjoterapii, Wydział Nauk o Zdrowiu, Uniwersytet Jagielloński Collegium Medicum w Krakowie

CZAS TRWANIA

36 miesięcy

WYSOKOŚĆ WYNAGRODZENIA

140 000 zł /rok (brutto-brutto)

WAŻNE TERMINY

Termin składania ofert: 31.12.2024 r.

Preferowana data rozpoczęcia pracy: 01.02.2025 r.

DOKUMENTY (w języku polskim)

• list motywacyjny
• życiorys
• kopia dyplomu doktorskiego
• dokumenty potwierdzające osiągnięcia naukowe w tym lista publikacji, wystąpień konferencyjnych, grantów.

• dodatkowe dokumenty, które mogłyby wzmocnić aplikację (według uznania kandydata),
• informacja o przetwarzaniu danych osobowych wraz ze zgodą (podpisany skan)
• oświadczenie o spełnianiu warunków wymaganych przez Narodowe Centrum Nauki (podpisany skan)

INFORMACJE O PRZEBIEGU POSTĘPOWANIA KWALIFIKACYJNEGO

Z wybranymi kandydatami będzie prowadzona rozmowa kwalifikacyjna w języku polskim. 

W szczególności oceniane będą następujące aspekty

• ogólna znajomość tematyki, w której kandydat zamierza prowadzić badania naukowe,
• rozumienie metodologii badań i zasad analizy wyników,
• znajomość języka angielskiego.

Osoby, które nie zgłoszą się na rozmowę kwalifikacyjną, nie będą uwzględnione w postępowaniu kwalifikacyjnym

Kontakt

p.link-lenczowski@uj.edu.pl