- Centrum Zarządzania Projektami CM - https://nauka.cm-uj.krakow.pl -

Oferta pracy na stanowisku typu post-doc. w projekcie Sonata-Bis

Posted By Renata Sobieszczańska-Horbatowska On In | Comments Disabled

Oferta pracy dotyczy stanowiska typu post-doc. (adiunkt z doktoratem) w projekcie finansowanym przez Narodowe Centrum Nauki, Sonata Bis (2023/50/E/NZ4/00360), pt. Celowana komórkowa sygnalizacja cząsteczek siarkowodoru jako brakujący klucz do fundamentalnej i klinicznej interpretacji schorzeń przełyku.

 

 Wymagania (PL):

– doktorat z zakresu nauk biomedycznych
– bardzo dobra znajomość praktyczna technik biologii molekularnej i biochemii (np. Western blot, PCR, ELISA i inne)
– doświadczenie i bardzo dobra umiejętność prowadzenia hodowli komórkowych in vitro,
– doświadczenie naukowe i samodzielność badawcza udokumentowane publikacjami (w tym m.in. umiejętność opracowania tekstów naukowych, prezentacji naukowych, planowania prac eksperymentalnych oraz analizy danych z użyciem narzędzi statystycznych)
– zdolność do opanowania i implementacji nowych metod badawczych i protokołów eksperymentalnych (gotowość do opanowania umiejętności pracy z użyciem platformy Seahorse® do oceny aktywności mitochondriów)
– gotowość do ukierunkowania pracy naukowej i zainteresowań badawczych w stronę biologii molekularnej i farmakologii schorzeń przewodu pokarmowego
– bardzo dobra znajomość biomedycznego języka angielskiego
– spełnienie wymagań formalnych w kwestii zatrudniania na stanowisku Postdoc w ramach projektów NCN

 

Requirements (EN):

 

Mile widziane (PL):

– znajomość podstawowych technik inżynierii genetycznej (np. klonowanie molekularne, sekwencjonowanie DNA, hodowle bakteryjne) oraz zasad pracy w laboratorium o standardzie BSL2

– zainteresowanie patogenezą i farmakologią schorzeń przewodu pokarmowego, fizjologią i patofizjologią funkcjonalną mitochondriów oraz post-translacyjnymi modyfikacjami białek wewnątrzkomórkowych, a także sygnalizacją endogennych gazowych mediatorów (biosynteza i metabolizm siarkowodoru, tlenku węgla i tlenku azotu)

– umiejętność analizy danych uzyskanych z oznaczeń technikami wysokoprzepustowymi (np. proteomika)

– umiejętność pracy w środowisku R

– bezpośrednie doświadczenie w pracy naukowej ze zwierzętami laboratoryjnymi

– umiejętność pracy z biologicznym materiałem klinicznym oraz umiejętność wyprowadzania pierwotnych hodowli komórkowych

– doświadczenie badawcze w jednostkach zagranicznych

 

Preferred Qualifications (EN):

 

Warunki zatrudnienia (PL):

– gotowość do pracy w ruchomym, ale pełnoetatowym trybie czasowym, zależnym od danego protokołu eksperymentalnego i zadań planowanych przez kierownika projektu (pełny etat, 40 godzin/tydzień w zadaniowym systemie czasu pracy)

– wynagrodzenie: średnio 140.000 zł „brutto-brutto” na rok (ok. 9000 zł brutto m-c, ok. 7 000 zł netto m-c)

– miejsce wykonywania pracy: Ośrodek Biomedycyny i Nauk Interdyscyplinarnych, Wydział Lekarski, Uniwersytet Jagielloński – Collegium Medicum w Krakowie

– praca w dynamicznie rozwijającym się zespole i ośrodku badawczym, realizującym projekty badawcze we współpracy z prestiżowymi jednostkami zagranicznymi (np. Erasmus MC w Rotterdamie (Niderlandy), Georgia State University (USA), Baylor University Medical Center (USA), University of Glasgow (Wielka Brytania), Newcastle University (Wielka Brytania), Uniwersytet Neapolitański Fryderyka II (Włochy); dotychczasowe publikacje zespołu ukazały się w czołowych czasopismach z dziedziny farmakologii, biologii molekularnej, biochemii i gastroenterologii (np. Redox Biology (5-IF= 11.7), Journal of Controlled Release (5-IF=10.6), Acta Pharmaceutica Sinica B. 5-IF=14.1), Nature Communications (5-IF=16.1), Chemical Reviews (5-IF=63.6) i inne); nasz zespół realizował i realizuje wiele projektów finansowanych przez Narodowe Centrum Nauki, Narodowe Centrum Badań i Rozwoju, Ministerstwo Nauki i Szkolnictwa Wyższego i innych; Ośrodek i projekt są kierowane przez prof. dr hab. n. med. Marcina Magierowskiego (laureata nagrody NCN 2024 w dziedzinie Nauk o Życiu);

 

Więcej o nas:

– https://gameg.cm-uj.krakow.pl

– https://www.youtube.com/watch?v=FIpYIsoKvYA&t=4s

– https://www.youtube.com/watch?v=L_jIb-10ux8&t=3386s

 

Employment Conditions (EN):

 

Learn more about us:

– https://gameg.cm-uj.krakow.pl

– https://www.youtube.com/watch?v=FIpYIsoKvYA&t=4s

– https://www.youtube.com/watch?v=L_jIb-10ux8&t=3386s

 

Opis zadań (PL):

Protokół eksperymentalny opiera się na odpowiednich modelach tej jednostki chorobowej in vitro z wykorzystaniem unikatowej kombinacji ludzkich linii komórkowych nabłonka przełyku, w tym modyfikowanych genetycznie techniką CRISPR/Cas9 oraz na mikrochirurgicznym modelu zwierzęcym. Porównawczo, zaplanowano również kliniczną analizę molekularną bioptatów błony śluzowej przełyku pobranych endoskopowo od pacjentów. Projekt zakłada kompleksowe zbadanie mechanizmów biochemicznych i molekularnych biorących udział w rozwoju przełyku Barrett’a z zastosowaniem technik biochemicznych oraz proteomicznych. Ten patologiczny proces może być potencjalnie modulowany przez mitochondrialnie ukierunkowane działanie gazowego mediatora jakim jest siarkowodór (H2S) oraz zależną od biodostępności tej molekuły post-translacyjnej persulfidacji białek wewnątrzkomórkowych. Zakładamy, że procesy te mogą być odwracalne i będziemy w tym celu implementować w warunkach przedklinicznych odpowiednie nowatorskie proleki uwalniające H2S weryfikując skuteczność terapeutyczną oraz prewencyjną takich rozwiązań farmakologicznych. Projekt jest realizowany w wieloośrodkowej współpracy międzynarodowej.

 

Przykładowe zadania projektowe:

– prowadzenie hodowli komórkowych w ramach modelu in vitro przełyku Barrett’a celem weryfikacji terapeutycznej efektywności nowych proleków z użyciem metod klasycznych oraz czytnika wielodetekcyjnego w warunkach normoksji oraz hipoksji

– prowadzenie hodowli komórkowych w kierunku oceny zmian aktywności mitochondrialnej pod wpływem badanych związków z użyciem platformy Seahorse®; opracowanie protokołu oraz implementacja nowej metody

– projektowanie i wykonanie oznaczeń molekularnych, w tym m.in. oznaczenie poziomu białek i ich ekspresji z użyciem immunelektroforezy kapilarnej (system Jess® Automated Western Blot), technologii multipleksowania xMAP®

– biochemiczne przygotowanie lizatów komórkowych do oznaczeń proteomicznych oraz persulfidomicznych

– projektowanie wektorów lentiwirusowych celem modyfikacji genetycznej linii komórkowej z użyciem techniki CRISPR/Cas9 oraz wygenerowanie odpowiednich linii komórkowych (GMM)

– projektowanie i wykonanie oznaczeń molekularnych w materiale klinicznym oraz zwierzęcym (w tym opracowanie metody izolacji frakcji mitochondrialnych)

– analiza i archiwizacja danych, przygotowanie publikacji naukowych oraz doniesień konferencyjnych

– współudział w opiece nad młodszymi pracownikami naukowymi (np. doktoranci)

 

Job Description (EN):

The experimental protocol is based on relevant in vitro models of this disease, utilizing a unique combination of human esophageal epithelial cell lines, including genetically modified CRISPR/Cas9 models, as well as a micro-surgical animal model. Additionally, the project includes a comparative clinical molecular analysis of endoscopically obtained esophageal mucosa biopsies from patients.

The project aims to comprehensively investigate biochemical and molecular mechanisms involved in the development of Barrett’s esophagus using biochemical and proteomic techniques. This pathological process may potentially be modulated by the mitochondria-targeted action of hydrogen sulfide (H2S), a gasotransmitter, as well as H2S-dependent intracellular protein persulfidation, which is linked to the bioavailability of this molecule. We hypothesize that these processes might be reversible, and to explore this, we will implement novel H2S-releasing prodrugs in preclinical conditions, assessing their therapeutic and preventive potential. The project is conducted as part of a multi-center international collaboration.

 

Example Research Tasks:

 

Dodatkowe informacje:

– wymagane dokumenty: CV, list motywacyjny

– mile widziane: referencje od poprzednich pracodawców, opiekunów naukowych

– czas trwania pracy: do 54 miesięcy

– informację o przetwarzaniu danych osobowych (podpisany skan)

– oświadczenie o spełnianiu warunków wymaganych przez Narodowe Centrum Nauki (podpisany skan)

WAŻNE TERMINY

WAŻNE INFORMACJE

Zgłoszenia należy wysyłać na adres m.magierowski@uj.edu.pl.

 

Additional Information:

 FINANCING INSTITUTION

 DURATION

 CONDITIONS OF EMPLOYMENT

 IMPORTANT DEADLINES

 

 

Applications should be sent to: m.magierowski@uj.edu.pl