Charakterystyka WGS izolatów Escherichia coli pochodzących od polskich pacjentów z bakteriemią, u których wystąpiła sepsa lub wstrząs septyczny.

Zakażenia krwi wywołane przez wielolekooporne szczepy E. coli stanowią poważne zagrożenie epidemiologiczne, szczególnie w warunkach szpitalnych i na oddziałach intensywnej terapii. Badanie pozwoli uzyskać cenne, szczegółowe dane dotyczące mechanizmów oporności na antybiotyki szczepów E. coli izolowanych z zakażeń krwi w Polsce. Analiza danych WGS umożliwi identyfikację markerów genetycznych lub fenotypowych związanych z niekorzystnymi skutkami klinicznymi lub zwiększoną patogennością. Badanie pozwoli na ocenę rozprzestrzeniania się klonów E. coli w polsce, a także rozpowszechnienia chromosomalnych i plazmidowych determinantów oporności w populacji polskiej.

Celem badania jest:

• Identyfikacja dominujących klonów i genów oporności zależnych od plazmidów oraz ocena trendów czasowych i potencjalnych dróg transmisji w placówkach opieki zdrowotnej na podstawie izolatów zebranych w ciągu ostatnich 20 lat.

• Wyjaśnienie roli plazmidów i mobilnych elementów genetycznych w rozprzestrzenianiu się oporności,

• Wsparcie rozwoju lokalnych i krajowych strategii nadzoru nad lekami przeciwdrobnoustrojowymi i kontroli zakażeń.

Badanie może mieć implikacje dla przyszłych terapii: wnioski uzyskane z profilowania WGS mogą ukierunkować przyszłe podejścia terapeutyczne, szczególnie w rozwoju inhibitorów β-laktamaz nowej generacji i optymalizacji kombinacji β-laktam/inhibitor ukierunkowanych na wielolekooporne szczepy E. coli.

Ponadto projekt przyczyni się do:

• Poszerzenia wiedzy na temat genetyki i epidemiologii lekoopornej bakterii E. coli w Polsce,

• Rozwijania wiedzy specjalistycznej w zakresie sekwencjonowania całego genomu (WGS) i nowoczesnych narzędzi bioinformatycznych,

• Utworzenia genomicznej i klinicznej bazy danych, która będzie mogła być wykorzystana do przyszłych badań, publikacji i współpracy międzynarodowej.

• Wspierania lokalnego przewodnika po optymalizacji leczenia empirycznego i celowanej terapii przeciwdrobnoustrojowej u pacjentów z sepsą i bakteriemią. Odkrycia te przyczynią się również do globalnego zrozumienia rozwoju i rozprzestrzeniania się oporności wśród bakterii E. coli. Badanie molekularnych mechanizmów oporności szczepów E. coli może również dostarczyć informacji na temat szerszych strategii przetrwania bakterii, pomagając zrozumieć, jak inne patogeny szpitalne adaptują się do trudnych warunków.

Powrót >