Mikrobiom zatok przynosowych - dynamika czasowa i zmiany spowodowane przez selektywną presję antybiotykową

Opis projektu:
Nos i zatoki przynosowe osób zdrowych i chorych na przewlekłe zapalenie zatok są skolonizowane przez liczne bakterie, zarówno korzystne dla zdrowia, jak i potencjalnie patogenne. Antybiotyki, również te stosowane z powodu innych schorzeń niż zapalenie zatok, mogą wpływać na mikrobiom zatok, jednak ten efekt nie został dotychczas dostatecznie poznany. Efektem ekspozycji na antybiotyki może być zubożenie mikrobioty, indukcja dysbiozy i zwiększenie kolonizacji szczepami opornymi na antybiotyki. Główne cele projektu to zbadanie dynamiki czasowej mikrobiomu zatok oraz ocena efektu antybiotykoterapii systemowej. Wymazy z przewodu nosowego środkowego będą pobierane od pacjentów z przewlekłym zapaleniem zatok i osób zdrowych raz na trzy miesiące przez rok, aby scharakteryzować unikalny skład mikrobioty każdego uczestnika i obserwować naturalne zmiany mikrobiomu zachodzące w czasie. Dodatkowo od pacjentów bez patologii zatok i nosa, otrzymujących antybiotyki z powodu infekcji innych niż zapalenie zatok, pobierane będą próbki przed i po terapii antybiotykowej, a następnie raz na trzy miesiące przez rok. W badaniach zastosowane będzie sekwencjonowanie 16S rRNA metodą Oxford Nanopore umożliwiającą generowanie długich odczytów, co pozwala na dokładniejsze scharakteryzowanie mikrobioty niż stosowane dotychczas metody (sekwencjonowanie amplikonowe). Jako metoda komplementarna wykorzystana będzie hodowla bakterii z oznaczeniem oporności na antybiotyki. Projekt ma na celu dostarczenie informacji na temat czasowej zmienności mikrobiomu zatok. Informacje te zostaną zdeponowane w publicznych repozytoriach i udostępnione innym badaczom. Ponadto projekt ma wykazać, czy zatoki stanowią rezerwuar mikroorganizmów opornych na antybiotyki w zdrowej populacji i u pacjentów z przewlekłym zapaleniem zatoki oraz ocenić wpływ antybiotyków na mikrobiom zatok i występowanie bakterii antybiotykoopornych.

Powrót >